L'IGBMC recrute en CDD pour la plarteforme Genomeast.
Missions
Prendre en charge les projets de séquençage haut débit de la plateforme depuis la validation des échantillons de départ jusqu’au séquençage des banques produites et mettre en œuvre de nouveaux protocoles pour étoffer le catalogue de la plateforme.
Activités principales :
- Mettre en œuvre la technologie de séquençage haut débit Illumina :
- Contrôler et valider les échantillons de départ, ADN et ARN
- Générer les banques de séquençage pour des applications diverses (Total RNA-seq, mRNA-seq, ChIP-seq, small RNA-seq ,…) selon les protocoles en vigueur sur la plateforme en les adaptant si besoin
- Préparer les plans de flowcells et séquencer les banques sur le séquenceur Illumina de la plateforme
- Enregistrer les opérations réalisées, valider les contrôles qualité définis dans les modes opératoires et assurer le suivi des dossiers auprès des porteurs de projet
- Evaluer et implémenter de nouveaux protocoles/applications pour étoffer le catalogue de prestations de la plateforme GenomEast :
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- Participer à la rédaction du cahier des charges et à la planification des projets de développement
- Evaluer les solutions retenues en s’assurant de la traçabilité des opérations et le suivi du projet avec les porteurs de projet
- Définir les caractéristiques optimales des échantillons de départ à fournir et les contrôles qualité intermédiaires à effectuer avant séquençage
- Rédiger la documentation utilisateur associée.
Activités associées :
- Former les utilisateurs du service sur les équipements mis à disposition par la plateforme (Qubit, Covaris E220)
- Participer à la gestion du parc d’équipements et des produits et consommables de la plateforme
- Participer activement au maintien et à l’amélioration du Système de Management de la Qualité de la plateforme
Compétences techniques
Connaissances :
- Connaissances générales en biologie cellulaire et moléculaire.
- Des connaissances sur les approches en transcriptomique, génomique et/ou épigénétique par séquençage à haut débit seraient un plus.
Compétences opérationnelles :
- Maitrise des techniques générales de biologie moléculaire (extraction, purification, hybridation, marquage, amplification et autres manipulations enzymatiques d’acides nucléiques)
- Maitrise des appareillages nécessaires aux manipulations d’acides nucléiques (spectrophotomètre, fluorimètre, thermocycleur, lyophylisateur...)
- Maitrise des outils informatiques pour l’enregistrement des données (Pack Office), pour le pilotage d’appareils (logiciels dédiés), et pour la navigation web
Compétences comportementales :
- Aptitude au dialogue avec des scientifiques issus de différents domaines
- Rigueur et organisation
- Sens du service
- Respect des règles de déontologie et de confidentialité
- Planification et gestion des priorités
- Esprit critique et curiosité scientifique
- Travail en équipe
Informations complémentaires
Travail en journée du lundi au vendredi. Déplacements occasionnels pour assister à des formations, des conférences ou réunions, principalement en France
Profil : Niveau DUT, BTS ou Licence.
Modalités de candidature
Envoyer CV et Lettre de motivation, sous la référence RCT011-2022 à Schmitt Solène (Cette adresse e-mail est protégée contre les robots spammeurs. Vous devez activer le JavaScript pour la visualiser.).